首先，不同纸张所选用的制造原料是不同的。在造纸原料中，原生浆指的是纯净的原生纤维，包括原生的木浆、竹浆、秸秆浆等。再生浆与此相对应，是使用回收材料制作的浆液，包括回收木材、竹材、草浆等。国家标准规定，制造卫生纸时允许使用再生浆，而制造面巾纸时要求更为严格，不能使用再生浆，必须使用原生浆。
在选购纸品时，人们经常会看到产品说明中标注木浆、原木浆、原生木浆等字样，看起来差别不大，但这些纸浆信息恰恰能够说明纸品的质量。从制造成分上来看，原木浆是完全以木材作为提取对象的，未加工过的木浆；原生木浆除了有木材外，还可能添加了稻草、棉麻等原料，纯度低于原木浆；纯木浆由纯木纤维制作，但很可能包含再生材料制作的再生浆，质量不一。
除了原料之外，卫生纸和面巾纸生产时采用的卫生标准也不一样。相关资料显示，两者在湿度韧性、纸含菌量、可迁移性荧光增白剂等指标上均有不同要求。比如面巾纸上细菌菌落总数要求不得多于200个/克，不得检测出致病性球菌和肠道致病菌；而卫生纸一般要求消毒后的细菌菌落总数不得多于600个/克。另外，面巾纸上要求“无可迁移性荧光增白剂”；而对卫生纸则没有此项要求……总的来说，面巾纸在卫生标准上比卫生纸要更严格，使用时也更为安全。
综合价格、使用体验、卫生标准等种种因素，目前国内外都流行“专纸专用”的说法。专家建议，由于卫生纸擦脸容易破碎，触感较为粗糙，且卫生标准也没有面巾纸那么严格，所以建议将卫生纸作为厕纸使用；面巾纸具有一定的耐湿度，可在沾湿后，作为面部、手部的清洁，不过也不宜替代卫生纸使用，会堵塞马桶；而餐巾纸可在就餐时使用，用来擦嘴。
大家平时在选购生活用纸时，要留意商品的基本信息，分辨自己购买的纸品种类和质量。一方面可以观察上文提到的纸浆种类，另一方面还可以注意面巾纸的等级信息。一般的面巾纸根据柔软度、吸水性、韧性等性质的不同，会标注优等品、一等品和合格品3个档次，购买时可根据需求选取。
此外，专家也提醒，在外就餐时要尽可能使用餐巾纸。一些街边的餐馆为了成本考虑，会摆放抽取式的卫生纸或者卷纸，而事实上这类纸并不能替代餐巾纸使用。因为如果不小心遇到用回收纸生产的劣质卫生纸，反而会有潜在危害。
